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Resumo

Mesmo com a vacinação da Covid-19 iniciada, diversos países ainda estão apresentando novos casos, o vírus do SARS-CoV-2 requer novos e aprofundados estudos para encorajar novas estratégias para o manejo desta doença. Desde o início da pandemia já foram relatados que os miRNAs podem inibir a tradução do genoma viral para evitar a replicação do vírus e também, podem estabilizar o RNA viral em células e/ou tecidos específicos. Nesta perspectiva, este trabalho de pesquisa teve como objetivo predizer microRNAs e avaliar computacionalmente novos candidatos a inibição do mecanismo molecular do SARS-CoV-2. Este trabalho iniciou-se buscando as sequências de nucleotídeos de 1578 miRNAs de caráter aleatório, obtidas no banco de dados de microRNAs (miRBase). O software MIRTARGET/Sfold foi responsável pelo emparelhamento das sequências de nucleotídeos de miRNA e mRNA das estruturas de ACE2 e TMPRRS2 (proteínas que facilitam a replicação do Covid-19). Uma rede de interação de processos biológicos foi gerada para verificar a possibilidade de interação e validação dos miRNAs encontrados. Estruturas da ACE2 foram modeladas por homologia com base na interação dos miRNAs e realizado a técnica de docking molecular para verificar a diminuição de afinidade de ligação com a proteína Spike do vírus. Os resultados desse estudo mostraram que os miRNAs hsa-miR-98-5p e hsa-miR-200c conseguiram agir nos mRNAs da TMPRSS2 e ACE2, respectivamente. Ligações de hidrogênio e ligações do tipo 8MER foram identificadas entre os miRNA e mRNA, exibindo interações firmes atuando na região 3'UTR - a região de indução e degradação do mRNA. Além disso, a estrutura da ACE2 gerada por homologia conseguiu apresentar uma afinidade de ligação menor com a proteína spike do que a estrutura da ACE2 não alterada. Neste estudo foi possível encontrar dois miRNAs que podem ser alternativas na diminuição da interação das proteínas ACE2 e TMPRSS2 com a proteína spike do SARS-CoV-2.

Palavras-chave: Bioinformática , COVID-19, microRNA